Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71F1Q96KD3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms