Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms