Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms