Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms