Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TM4SF18Q96CE8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms