Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms