Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRG4Q92954 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRG4Q92954 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms