Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTTNBP2Q8WZ74 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms