Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP3Q8WYN3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms