Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms