Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRSK1Q8TDC3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms