Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms