Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms