Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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