Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX29P2Q8IUI4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms