Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC84Q86UT8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms