Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms