Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms