Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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