Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms