Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms