Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms