Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms