Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC12Q6PEW1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms