Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms