Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTSL3PQ5NE16 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms