Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms