Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM3Q53FZ2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms