Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms