Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC58Q4VC31 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms