Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN3Q4LDR2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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