Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00303Q3SY05 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms