Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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