Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
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