Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM187BQ17R55 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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FAM187BQ17R55 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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