Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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RTN1Q16799 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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RTN1Q16799 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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RTN1Q16799 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTN1Q16799 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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