Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYPL1Q16563 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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