Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms