Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SIX1Q15475 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SIX1Q15475 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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