Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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