Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRRQ15256 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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