Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEA1Q15075 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms