Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD3Q15054 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLD3Q15054 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
POLD3Q15054 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD3Q15054 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD3Q15054 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD3Q15054 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD3Q15054 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD3Q15054 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD3Q15054 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD3Q15054 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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