Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R3HDM1Q15032 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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