Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLCA4Q14CN2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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