Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPRCAPQ14761 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PTPRCAPQ14761 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRCAPQ14761 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRCAPQ14761 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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