Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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