Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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