Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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