Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTCH1Q13635 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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